Las micosis invasivas provocadas por el género Candida son las más frecuentemente informadas en los hospitales terciarios a nivel mundial. En los últimos tiempos se han observado cambios epidemiológicos y resistencia de algunas especies a agentes antimicóticos de primera línea. Este trabajo tiene como objetivo caracterizar fenotípicamente las especies de levaduras aisladas de hemocultivos de pacientes ingresados en el Hospital Clínico Quirúrgico ¨Hermanos Ameijeiras¨ en el período 2012-2013. Para ello se estudiaron 100 cepas de levaduras a partir de hemocultivos de pacientes ingresados en diferentes servicios del Hospital Clínico Quirúrgico ¨Hermanos Ameijeiras¨ de enero del 2012 a diciembre del 2013. La identificación y la susceptibilidad antifúngica se realizaron mediante el sistema automatizado Vitek 2 Compact empleando las tarjetas YST y AST-YS01, respectivamente. Se evaluaron los antimicóticos 5-Fluocitosina, Fluconazol, Anfotericina B y Voriconazol. El 89% de las cepas correspondió al género Candida y el resto a otros género no comunes como Cryptococcus, Trichosporon, Kodamaea y Stephanoascus. Dentro del género Candida, el 71,9% correspondió a otras especies diferentes de C. albicans, la cual quedó en una cuarta posición con solo un 10,1%, a pesar de ser esta especie la más informada a nivel mundial como causa de candidemia. La especie más frecuente fue C. parapsilosis (36%), seguida por C. tropicalis (20,2%) y C. guilliermondii (15,7%). Se obtuvieron altos porcientos de sensibilidad a los 4 antifúngicos: Anfotericina B (93.2%), Fluconazol (94,4%), Voriconazol (97,7%) y 5-Flucitosina (97,7%). C. albicans mostró un 100% de sensibilidad para todos los antifúngicos y C. guilliermondii fue la especie más resistente con 21,4% frente a Anfotericina B y 14,3% a Voriconazol y una sensibilidad dependiente de la dosis para Fluconazol de 28,6%. Estos resultados muestran que el sistema Vitek 2 Compact permite realizar la identificación hasta nivel de especie de todas las cepas de levaduras aisladas con resultados clasificados como excelente y muy buena identificación. El género Candida fue el más frecuente, con más de un 93% de sensibilidad a Anfotericina B, Fluconazol, Voriconazol, y 5 -Flucitosina. El mayor porcentaje de fungemias se obtuvo en las unidades de atención al grave (unidades de cuidados intensivos, unidad de cuidados de cirugía cardiovascular y las salas de hematología-oncología). C. parapsilosis se aisló en mayor cuantía a partir de muestras provenientes de salas de hematología y hemodiálisis.